M. Jean-Claude Guidarini, conservateur des archives de la maison Puget, a bien voulu me communiquer une liste, probablement complète, de travaux. Je cite [avec mes remarques entre crochets] :

Généralités

La manufacture Puget a été fondée en 1841. Elle prend le nom de Th. Puget père et fils en 1866.
Eugène Puget décède en janvier 1892.
La transmission pneumatique est utilisée pour la première fois par Jean-Baptiste Puget en 1893 (Lautrec, Tarn).
Puget achète les droits du système pneumatique Weigle en 1895.

Travaux dans le Nord

Églises :

1901 Mouvaux, St François [voir Mouvaux, St François]
1904 Lille Sacré-Cœur [en fait, réparation de la soufflerie - voir Lille, Sacré Coeur - Orgue de tribune]
1914 Lille Saint-Michel [voir Lille, St Michel - Orgue de tribune]
 
L'église du Très Saint Sacrement à Fives comportait aussi un orgue de Puget (origine et devenir inconnus). Voir cette page.

Théâtres, salons, écoles :

1898 Hellemmes-Lille Mr Pascalin [actuellement à Gruson, ND de la Visitation]
1900 Lille Conservatoire [reconstruit par Jacquot-Lavergne ; transféré à Agen - voir Lille, Conservatoire - grand auditorium]
1902 Lille Bruggemann [professeur d'orgue au conservatoire ?]
1904 Lille Théâtre
1905 Lille Dr Bédart
1905 Lille Mr Boittiaux
1910 Lille Mr Franchome
1912 Lille Dr Gaudier
1914 Lille Nouveau Théâtre